• Trường Đại học Chính trị - trực thuộc Bộ Quốc phòng nâng cấp từ trường Sĩ quan Chính trị ngày 23/12/2010
• Trường Đại học Kỹ thuật - Hậu cần Công an Nhân dân (T36) - Bộ Công an có trụ sở tại thị trấn Hồ, huyện Thuận Thành
• Trường Đại học PCCC - Bộ Công an đang được xây dựng tại xã Việt Đoàn, huyện Tiên Du (thuộc Làng Đại học II)
• Học viện Ngân hàng - Phân viện Bắc Ninh
• Học viện Chính sách và Phát triển (trực thuộc Bộ Kế hoạch và Đầu tư)
• Trường Đại học Công nghệ Đông Á (Võ Cường - TP Bắc Ninh)
• Trường Đại học Thể dục Thể thao Bắc Ninh (thành phố Từ Sơn)
• Trường Đại học Quốc tế Bắc Hà đang được xây dựng tại Làng Đại học thuộc thị trấn Lim, tỉnh Bắc Ninh
• Trường Đại học Kinh Bắc có trụ sở tại phường Vũ Ninh, TP Bắc Ninh
• Trường Đại học Nha Trang (cơ sở Bắc Ninh)
• Trường ĐH Kinh doanh và Công nghệ Hà Nội cơ sở 2 tại thành phố Từ Sơn
• Trường Đại học Công nghiệp Dệt may thời trang Hà Nội phân sơ sở 2 Khu ĐTM Khai Sơn, Thuận Thành

Dự án

• Đại học Luật Hà Nội - cơ sở 2 (tại phường Đồng Nguyên, thành phố Từ Sơn)[11]
• Đại học Tài nguyên và Môi trường Hà Nội - Cơ sở 2 (tại phường Đồng Nguyên, thành phố Từ Sơn)[12][13]
• Học viện Phụ nữ Việt Nam (tại xã Tân Chi – Tiên Du – Bắc Ninh làm cơ sở đào tạo, dự kiến khởi công trong giai đoạn 2015-2020)[cần dẫn nguồn]
• Đại học Dược Hà Nội đang được xây dựng tại Làng Đại học tỉnh Bắc Ninh[cần dẫn nguồn]
• Đại học Bách khoa Hà Nội đang được xây dựng tại Làng Đại học tỉnh Bắc Ninh[cần dẫn nguồn]
• Đại học Thống kê (Nâng cấp từ trường Cao đẳng Thống kê)[cần dẫn nguồn]

Viện nghiên cứu

• Viện Nghiên cứu phát triển kinh tế - xã hội Bắc Ninh
• Viện Quy hoạch, Kiến trúc Bắc Ninh
• Viện Nghiên cứu Da giày - Bộ Công thương, Cơ sở 2: Phường Đồng Nguyên, thành phố Từ Sơn
• Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản I - Bộ NN&PTNT, phường Đình Bảng, thành phố Từ Sơn